Support（研究支援）

研究支援	担当者	支援内容	備考
質量分析解析、NMR解析	和泉・井貫	生体試料からの精製物（代謝産物、脂質など）をMSあるいはNMRによる構造解析を行う。	まず担当者と相談。共同研究ベースが原則。NMRは、測定化合物の量（1mgが望ましい）、純度による。素性（ペプチド、核酸etc）の情報があることが望ましい。MSは、分子量の制約は特にありませんが2000以下が好ましい。
LC・分取・質量分析解析	和泉	各種生体試料からのリガンドあるいは抗原探索を行う。各種試料から、最適なクロマトグラフィーを選定し、微量分取（96-wellプレート）を実施するともに質量分析を行う。その後、分取プレートのレポーターアッセイに供することで活性フラクションの選定、MSスペクトルからの構造予測を行う。	まず担当者と相談。共同研究ベースが原則。リガンドあるいは抗原探索のための研究デザインおよび試料調製法を相談し、詳細な実験計画を立てる。
CLIP法	淺原	RNA結合タンパクの標的RNAをCLIP法とNGSで決定する。他にRNAの安定性の解析方法であるSLAM-seqや、 ChIP-Seq,、Cut and Tag、ATAC-SeqなどのEpigenetic解析全般に関する相談。	まず担当者と相談。共同研究ベースが原則。培養細胞で行う。良い抗体あるいはTagに対する抗体を使用する。NGSはサンプル数が多い場合は外部委託する。バイオインフォマティクスについてもサポートいたします。東京医科歯科大のサービスとして双腕ロボット・ラボドロイドによるChIPが可能。
高解像度イメージング	三宅	超高解像度	医科研コアラボを使用。まず担当者と相談。
迅速遺伝子改変動物作製	改正・淺原	CRISPR/Cas9法による遺伝子改変マウスの作製および作製に関する相談。（BINDS（https://www.binds.jp/）による受託を通じての遺伝子改変・編集マウス作製支援も含む）	まず担当者と相談。和医大動物施設、東京医科歯科大動物施設を使用。実費。コンベンショナル環境で作製。
次世代NGSモノクローナル抗体作製	瀬川・浅野	古典的なハイブリドーマ作成によるモノクローナル抗体作成。次世代法による作製および作製に関する相談。	まず担当者と相談。
CRISPRスクリーニング支援	瀬川	CRISPRスクリーニングおよびそれに関する相談。	実験のコンサルティングは常時可能。実際の実験を行う場合は、実験者の派遣を求める場合がある。まず担当者と相談。実験デザイン、screen、NGS、解析まで提供可能
リソース共有　マウス共有支援	改正	遺伝子改変マウス、抗体、試薬などの情報に関する相談。	リストは作成しないが、相談事項、質問事項に対応する。
シングルセル解析、スライドシークエンス解析	山崎	Bulk RNA-seq 50% support 複数サンプルを依頼された場合、半数分を総括班で負担します。ご負担頂くのは以下の半分になります。・RNAをお送り頂く場合　25000円~/サンプル・frozen cellをお送り頂く場合　30000円~/サンプル（RNA prep込み）価格改定が行われている可能性もございますので、詳細はお問い合わせください。サンプル推奨要件・total RNA (20 ng/uL以上, 30uL以上) ・細胞 (10^5 ~ 10^6 個をQIAzolに) ・RIN >= 7 ・低濃度・低収量の場合も実施可能ですが、相談下さい。詳しくはウェブページをご覧下さい。 https://www.ngs.gen-info.osaka-u.ac.jp/service/sequencing Single cell RNA-seq support 2023.11.6より、サンプル数に関わらず半数分を上限にして総括班でサポートします。申込時に目的に関する簡単な記述と、データ返却後のfeedbackをお願いします。	お問い合わせは ko-to-zai_support@biken.osaka-u.ac.jp 技術的な質問はゲノム解析室 service@ngs.gen-info.osaka-u.ac.jp までお願いします。
マスサイトメーター解析	山崎	CyTOF、Symphonyが可能。	まず担当者と相談。固定サンプルを送ることは可能。
リピドーム・メタボローム、プロテオーム解析	和泉	各種生体試料からのリピドーム・メタボローム・プロテオーム解析を行う。	まず担当者と相談。共同研究ベースが原則。それぞれのオミクス解析の消耗品コストは1検体あたり3～5万円程度かかる（現時点では、和泉の経費で負担する予定ですがサンプル数が多くなり過ぎた場合は相談させて下さい）。
Single Cell TCR/BCR解析	山崎・堀	解析および解析結果の相談。
タンパク質構造解析・クライオ電顕	清水	遺伝子を提供してもらえば可能。	まず担当者と相談。共同研究ベースが原則。
数理モデリング解析	宇田	微分方程式や確率モデルなどによる生命現象のモデリングの支援を行う。	できればデータ取得前に、事前に相談されることが望ましい。データ取得後であっても相談は可能だが、モデルの範囲や効果はより限定されうる。
論文作成支援	改正、安友、堀、和泉、宇田、井貫	実験計画から論文作成までの相談。	担当者が様々な形で助言、指導。
機械（AI）学習	宇田	機械学習や統計的手法を用いたデータ解析の支援を行う。	できればデータ取得前に、事前に相談されることが望ましい。データ取得後であっても相談は可能だが、効果はより限定されうる。
分子設計・構造展開	井貫・長江	ドッキングシミュレーション等を活用した低分子化合物の分子設計、有機合成化学的アプローチによる構造展開支援。	まず担当者と相談。共同研究ベースが原則。BINDSによる受託も可能（https://www.binds.jp/）。
骨髄細胞、胎児幹細胞などを用いたキメラマウスの作製	木村	相談および手技の見学。	キメラマウスの作製受託は不可能。
retrogenic mouse作製	堀	TCR transgenicを含めた相談。	まず担当者と相談。TCRのベクターに関する情報提供も可能。
胸腺の器官培養（FTOC/RTOC）	木村	相談および手技の見学。
化合物ライブラリー	井貫	約3万個の化合物ライブラリー（約10000個のオリジナル化合物ライブラリー、約1200個の既知阻害剤ライブラリーなどを含む）。	無償提供可能。まず担当者と相談。BINDSを通して提供することになります（https://www.binds.jp/）。
自己抗原ペプチドライブラリー	山崎	1750個のマウスMHC class II (I-Ab)結合が予測される自己ペプチドのセミプールマトリックスプレート（96 well plate ２枚）を提供。	ご質問、提供依頼は ko-to-zai_support@biken.osaka-u.ac.jp まで。プレートは冷凍で発送。

研究支援ご希望の方は、まず ko-to-zai_support@biken.osaka-u.ac.jp まで支援希望内容をお送り下さい。担当からご連絡致します。